Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MED13Q9UHV7 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms