Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KDM5BQ9UGL1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5BQ9UGL1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms