Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms