Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms