Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCHIP1Q9P0W5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms