Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IFT57Q9NWB7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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