Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BRIP1Q9BX63 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms