Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MCMBPQ9BTE3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MCMBPQ9BTE3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms