Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC39A3Q9BRY0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms