Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TREX2Q9BQ50 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms