Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFT140Q96RY7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT140Q96RY7 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms