Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
USP47Q96K76 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP47Q96K76 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms