Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SMIM12Q96EX1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SMIM12Q96EX1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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