Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NXPE2Q96DL1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NXPE2Q96DL1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms