Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCL4L1Q8NHW4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCL4L1Q8NHW4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms