Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RUFY3Q7L099 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUFY3Q7L099 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms