Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD40Q6AI12 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ANKRD40Q6AI12 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms