Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VIRMAQ69YN4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms