Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP170Q5SW79 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CEP170Q5SW79 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CEP170Q5SW79 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms