Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
KLHL12Q53G59 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms