Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TWISTNBQ3B726 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms