Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ISXQ2M1V0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ISXQ2M1V0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms