Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDK4Q16654 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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