Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCN9AQ15858 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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