Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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SYCP1Q15431 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYCP1Q15431 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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