Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COL9A3Q14050 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
COL9A3Q14050 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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