Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGB3BPQ13352 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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ITGB3BPQ13352 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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ITGB3BPQ13352 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGB3BPQ13352 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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