Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CBX3Q13185 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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