Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PTPN13Q12923 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms