Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CGNL1Q0VF96 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGNL1Q0VF96 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms