Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CREMQ03060 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CREMQ03060 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CREMQ03060 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREMQ03060 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREMQ03060 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREMQ03060 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREMQ03060 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREMQ03060 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREMQ03060 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms