Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XPCQ01831 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XPCQ01831 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XPCQ01831 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XPCQ01831 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms