Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MAT1AQ00266 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms