Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ACTBP60709 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ACTBP60709 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ACTBP60709 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ACTBP60709 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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