Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGAEP38570 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGAEP38570 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms