Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID4AP29374 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms