Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCAP28676 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCAP28676 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GCAP28676 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GCAP28676 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms