Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PTX3P26022 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PTX3P26022 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms