Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD53P19397 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD53P19397 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD53P19397 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms