Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTN1P12814 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms