Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PGA3P0DJD8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms