Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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PKHD1P08F94 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
PKHD1P08F94 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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