Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
POLR1AO95602 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
POLR1AO95602 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms