Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF3O95398 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
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