Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATE1O95260 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATE1O95260 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATE1O95260 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms