Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEBLO76041 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEBLO76041 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEBLO76041 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEBLO76041 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NEBLO76041 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms