Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL13O43927 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms