Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB3O43889 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB3O43889 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CREB3O43889 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CREB3O43889 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CREB3O43889 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms