Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LRRTM2O43300 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LRRTM2O43300 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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