Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PHF1O43189 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PHF1O43189 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PHF1O43189 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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